水質在線監測系統集成的工作原理是將被測水體通過管路送入監測設備中，通過定量的化學反應或通過電化學原理測定水體中被測物質的含量。無論何種測定原理，均要求被測水體滿足儀器的使用標準。如果有大量懸浮物或泥沙進入系統，在水速不高的情況下，則水質在線監測系統集成中必定會產生堵塞和沉積，從而造成系統不能正常運轉或設備損壞。另外，泥沙也會造成泵水機構和儀器的傳感器磨損、鈍化，甚至無法正常工作。
水質在線監測系統集成主要是由一個監測中心，若干個固定監測站和專用GPRS/CDMA無線終端組成。監測中心對各個監測站進行控制指揮，各監測站收集各種污染參數，兩者間的控制信號和監測數據通過GPRS/CDMA無線終端傳送完成。監測中心既是各監測站的指揮中心，又是監測站監測數據的匯集、處理的存儲的數據庫。各監測站可設置為自動向監測中心發送信息；也可設置為平時處于待機狀態，在收到監測中心的指令后才開始啟動工作，將信息發送給監控中心。各監測站有數據采集。命令識別、數據發送的功能。
水質在線監測系統集成功能：
實時監控
對企業監測點的排污量、設備運行等情況進行實時監控，并以人性化的界面顯示有關數據；
數據接收
數據接收方式有兩種，一種是監測點通訊控制器定時向中心返回監測數據（一般按1個小時返回，也可以通過用戶設置）；一種是通過中心向監測點通訊控制器發送查詢指令，監測點通訊控制器返回當前監測的實時數據；
報警處理
當監測到排污超標、檢測設施非正常封閉等事故時，軟件能自動識別事故類型，并及時向環境監理部分發送報警信息，使環境監理部分能夠以較快的速度及時對企業的違規行為進行糾正、制止，從而保證了環境監理信息傳遞的順暢、完整。
